灭菌器操作分为管理员和操作员两个级别，管理员有系统维护和灭菌程序操作的权限，操作员只有灭菌程序操作权限。由管理员设置系统参数和灭菌参数．经过实际验证后，交付操作员使用。操作员每班首次工作,先空载预热方可使用。开关前门(装载门)装载灭菌物品,选择灭菌程序,之后整个灭菌工作由灭菌器自动完成。灭菌程序运行完后，打开后门(卸载门)，取出灭菌物品，正个灭菌工作结束。
       灭菌器系统管理员操作流程:                          
       接通水源和压缩空气源─>开机─>管理员─>输入密码─>系统维护(系统维护内容:①系统参数设置②灭菌参数设置③偏差校正④用户管理⑤打印机设置)─>退出。
       灭菌器操作员操作流程：
       接通水源和压缩空气源─>开机─>操作员─>开前门(装载门) ─>装入灭菌物品─>关前门(装载门) ─>输入密码─>选择灭菌程序(灭菌程序:①织物灭菌②器械灭菌③液体灭菌④自定义一⑤自定义二⑥BD测试) ─>自动运行灭菌程序(灭菌程序内容:①脉动段②升温段③排汽段④干燥段⑤结束段) ─>开后门(卸载门) ─>取出灭菌物品─>灭菌结束